More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3841 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  79.08 
 
 		 395 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  100 
 
 		 397 aa  822    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  66.67 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  62.4 
 
 		 395 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  59.49 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  55.93 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  51.52 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  44.25 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  44.11 
 
 		 410 aa  333  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  42.42 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  42.03 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  41.84 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  40.77 
 
 		 409 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  41.97 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  45.09 
 
 		 408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  42.06 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  41.18 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  41.62 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  41.51 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  41.13 
 
 		 394 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  40.84 
 
 		 405 aa  292  9e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  38.96 
 
 		 435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  40.21 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  39.03 
 
 		 408 aa  286  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 		 405 aa  285  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  39.13 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.83 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  39.95 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  39.95 
 
 		 390 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  44.23 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  39.79 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  39.71 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.24 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  40.1 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  38.81 
 
 		 466 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  40.62 
 
 		 391 aa  279  8e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.56 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.74 
 
 		 405 aa  277  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  38.88 
 
 		 449 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.9 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.98 
 
 		 399 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  41.43 
 
 		 399 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  37.38 
 
 		 480 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39.9 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  41.27 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  40.41 
 
 		 389 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  38.42 
 
 		 471 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  38.18 
 
 		 465 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  39.48 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  39.48 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.42 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  38.18 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  39.18 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  37.91 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  38.29 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  40.91 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  37.62 
 
 		 470 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  40.73 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  39.04 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.13 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  39.39 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  38.85 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  40.41 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  39.68 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  37.4 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  39.74 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.53 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  40.59 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  37.53 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.84 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.9 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  39.6 
 
 		 431 aa  263  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  38.24 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.58 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  39.49 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 		 398 aa  262  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  38.58 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  38.66 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  38.58 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  37.88 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  36.39 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.85 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  38.32 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  40.11 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.32 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  40.05 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  37.34 
 
 		 396 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.05 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  37.93 
 
 		 439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.05 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  38 
 
 		 435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  40.47 
 
 		 400 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  37.05 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  37.56 
 
 		 400 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  38 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  38.58 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  39.72 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.62 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  39.11 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>