More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1358 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  100 
 
 		 459 aa  943    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  55.68 
 
 		 449 aa  508  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  54.68 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  51.58 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  54.2 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  51.12 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  54.25 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  54.31 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  52.67 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  52.19 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  52.58 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  53.73 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  46.97 
 
 		 437 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  51.2 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  49.67 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  51.6 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  50.49 
 
 		 432 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  50.33 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  49.67 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  50.24 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  50.81 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  49.28 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  48.61 
 
 		 431 aa  353  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  41.18 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.24 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  36.83 
 
 		 393 aa  293  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  40.43 
 
 		 403 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  40.43 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.57 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  40.79 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.87 
 
 		 391 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.56 
 
 		 391 aa  283  6.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  37.47 
 
 		 390 aa  283  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.12 
 
 		 405 aa  282  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  40.15 
 
 		 393 aa  282  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.77 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  41.69 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  41.63 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  39.01 
 
 		 400 aa  277  3e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.62 
 
 		 405 aa  276  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.19 
 
 		 405 aa  275  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  38.29 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.78 
 
 		 395 aa  269  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.45 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  39.85 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.03 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  39.95 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  38.86 
 
 		 410 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.67 
 
 		 394 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  44.36 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  38.32 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.78 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  37.75 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  39.42 
 
 		 404 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  39.35 
 
 		 399 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  35.48 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  35.66 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  39.61 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.38 
 
 		 394 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  34.85 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  35.04 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  34.6 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  37.15 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.29 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  34.55 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  35.29 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  37.23 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  37.71 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  38.5 
 
 		 394 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  35.87 
 
 		 395 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  34.6 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  39.69 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.85 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.04 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  35.04 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.94 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  39.66 
 
 		 421 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  35.87 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  36.05 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  34.78 
 
 		 389 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.21 
 
 		 394 aa  253  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  38.39 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  35.85 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  38.54 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  35.85 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  38.15 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  36.48 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  36.03 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  36.36 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  35.78 
 
 		 395 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  35.78 
 
 		 395 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  39.01 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  36.61 
 
 		 396 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  36.79 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.44 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  37.14 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  34.14 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  34.9 
 
 		 395 aa  249  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  39.28 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  37.32 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>