More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4303 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  100 
 
 		 436 aa  876    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  52.17 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  51.54 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  51.56 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  50.25 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  50 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  48.66 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  50.81 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  50.12 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  51.13 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  51.38 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  49.65 
 
 		 431 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  49.65 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  50 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  49.31 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  49.07 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  51.83 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  48.17 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  50.36 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  51.88 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  47.96 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  49.75 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  43.52 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.48 
 
 		 390 aa  280  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  43.83 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.85 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.92 
 
 		 401 aa  274  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.94 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  43.19 
 
 		 393 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  39.12 
 
 		 409 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.39 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  39.46 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.19 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  36.21 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  38.42 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.83 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.92 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  40.75 
 
 		 380 aa  256  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37.47 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  39.04 
 
 		 410 aa  255  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  40.98 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  40.38 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.84 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  39.85 
 
 		 389 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  39.14 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.16 
 
 		 394 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  41.52 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  36.43 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  36.92 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  36.3 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  39.65 
 
 		 399 aa  249  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.97 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  36.03 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  40.45 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  39.07 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  36.25 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  41.04 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.36 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  39.11 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  37.69 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  36.68 
 
 		 395 aa  246  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  37.69 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  35.16 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  35.16 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  40.25 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.06 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  37.16 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  38.71 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  38.39 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  39.01 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.08 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  36.41 
 
 		 381 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.72 
 
 		 395 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  36.75 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  35.32 
 
 		 387 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  38.06 
 
 		 388 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  37.91 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  39.56 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  37.69 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  37.13 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  38.92 
 
 		 402 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  39.01 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  39.05 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  38.37 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  35.64 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  38.24 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  38.24 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  35.71 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  39.09 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  38.39 
 
 		 395 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  38.85 
 
 		 394 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  39 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  38.61 
 
 		 403 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  37.28 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  36.1 
 
 		 413 aa  239  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  41.31 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  41.31 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  41.31 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  39.26 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>