More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1415 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  100 
 
 
398 aa  818    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  98.49 
 
 
398 aa  807    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  46.82 
 
 
390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  44.22 
 
 
415 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  43.56 
 
 
399 aa  332  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  42.52 
 
 
395 aa  320  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  41.88 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.34 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  41.01 
 
 
390 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  41.16 
 
 
400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.09 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  40.31 
 
 
391 aa  302  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  43.46 
 
 
400 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  37.56 
 
 
393 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  41.18 
 
 
397 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  39.85 
 
 
403 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  39.95 
 
 
403 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  40.58 
 
 
392 aa  299  5e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  39.85 
 
 
403 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.19 
 
 
391 aa  299  6e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  40.53 
 
 
405 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  40.21 
 
 
394 aa  299  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.68 
 
 
405 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  39.56 
 
 
480 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  39.85 
 
 
449 aa  292  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  37.06 
 
 
404 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  39.2 
 
 
396 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  42.05 
 
 
380 aa  291  2e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  38.85 
 
 
402 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  37.06 
 
 
405 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.5 
 
 
402 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.67 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.29 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  38.5 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  36.57 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  36.57 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  37.66 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.68 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  41.11 
 
 
403 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  36.67 
 
 
389 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  36.93 
 
 
400 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  39.33 
 
 
395 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  37.53 
 
 
387 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  40.79 
 
 
396 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  37.18 
 
 
398 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.32 
 
 
435 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.02 
 
 
407 aa  276  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.17 
 
 
408 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  36.82 
 
 
425 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1761  amidohydrolase  42.89 
 
 
394 aa  276  5e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  37.5 
 
 
408 aa  275  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.46 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  38.4 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  38.4 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  37.44 
 
 
399 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  38.92 
 
 
385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  38.4 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  38.74 
 
 
387 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  37.57 
 
 
404 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  35.82 
 
 
401 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  38.66 
 
 
390 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  38.92 
 
 
385 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  36.5 
 
 
387 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.25 
 
 
387 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.96 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  37.86 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  36.51 
 
 
423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  35.5 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  38.62 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  38.92 
 
 
385 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  35.54 
 
 
424 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.7 
 
 
388 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  36.69 
 
 
397 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  36.75 
 
 
438 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  38.05 
 
 
410 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0591  amidohydrolase  40.42 
 
 
405 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.31 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  36.14 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  37.24 
 
 
413 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  38.04 
 
 
396 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  39.09 
 
 
383 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  36.64 
 
 
409 aa  265  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  38.18 
 
 
404 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  35.89 
 
 
396 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  36.96 
 
 
400 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  35.73 
 
 
423 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  38.26 
 
 
393 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  38.24 
 
 
395 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  35.66 
 
 
396 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  36.29 
 
 
387 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  36.78 
 
 
399 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  36.25 
 
 
405 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  37.07 
 
 
392 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  38.98 
 
 
392 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.73 
 
 
394 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  38.58 
 
 
383 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38 
 
 
465 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  34.88 
 
 
397 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  35.32 
 
 
398 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>