More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2374 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  100 
 
 		 470 aa  956    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  97.24 
 
 		 471 aa  868    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  45.37 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  46.75 
 
 		 424 aa  356  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  46.5 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  45.75 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  43.75 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  43.75 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  44.99 
 
 		 420 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  45.04 
 
 		 437 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  46.08 
 
 		 422 aa  339  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  45.23 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  43.63 
 
 		 421 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  43.17 
 
 		 438 aa  329  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  45.04 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  40 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  42.93 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  43 
 
 		 425 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  41.29 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  41.4 
 
 		 445 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  41.85 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  40.8 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  42.66 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  44.55 
 
 		 405 aa  303  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  43.42 
 
 		 437 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  38.37 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  40.55 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  40.94 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  40.69 
 
 		 422 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  40.69 
 
 		 422 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  41.34 
 
 		 575 aa  286  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  40.2 
 
 		 420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  38.89 
 
 		 1270 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  42.57 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  41.62 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  40.35 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  41.15 
 
 		 431 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  38.44 
 
 		 421 aa  276  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  42.05 
 
 		 367 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  41.43 
 
 		 427 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  39.3 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  40.66 
 
 		 426 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  36.65 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.09 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.31 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  38.04 
 
 		 419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.06 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  40.5 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  36.49 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  34.55 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  38.13 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  36.24 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  37.1 
 
 		 471 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  37.19 
 
 		 458 aa  243  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  40.86 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  36.86 
 
 		 471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  35.04 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  40.86 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  38.29 
 
 		 435 aa  239  9e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  36.61 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  34.34 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  35.04 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  36.78 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  37.75 
 
 		 437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  33.12 
 
 		 437 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.17 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  36.78 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  35.95 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.95 
 
 		 399 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  41.96 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.23 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  38.38 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  39.36 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  42.12 
 
 		 406 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  40.52 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  38.55 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  38.94 
 
 		 425 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  37.05 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  37.05 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  34.78 
 
 		 653 aa  225  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  38.2 
 
 		 383 aa  225  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  40 
 
 		 396 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  39.11 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  36.27 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  36.46 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  33.08 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.31 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  37.33 
 
 		 390 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  37.33 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  38.76 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  36.21 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  37.33 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  38.03 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  36.87 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  37.05 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  37.08 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  37.78 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  37.92 
 
 		 383 aa  221  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.03 
 
 		 387 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>