More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1999 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  100 
 
 		 430 aa  866    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  94.17 
 
 		 430 aa  807    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  46.82 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  46.92 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  45.22 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  44.81 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  46.14 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  43.2 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  43.75 
 
 		 470 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  43.75 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  46.15 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  43.17 
 
 		 453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  43.6 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  43.78 
 
 		 437 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  43.19 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  43.77 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  41.73 
 
 		 421 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  43.38 
 
 		 422 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  42.76 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  43.03 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  40.95 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  43.91 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  41.57 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  41.48 
 
 		 425 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  38.14 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  44.55 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  41.52 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  39.8 
 
 		 1270 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  43.5 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  43.55 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  43.7 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  43.11 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  43.11 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  43.11 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  43.75 
 
 		 450 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  42.99 
 
 		 427 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  41.39 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  41.75 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  42.93 
 
 		 442 aa  257  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  40.52 
 
 		 575 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  41.46 
 
 		 426 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.7 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  40.53 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.26 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  37.26 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  38.39 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  35.43 
 
 		 432 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  35.94 
 
 		 480 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  37.62 
 
 		 466 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  37.35 
 
 		 431 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  37.83 
 
 		 653 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  39.14 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.25 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  36.9 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  37.18 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  36.67 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.32 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  35.85 
 
 		 437 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  43.4 
 
 		 384 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  40.24 
 
 		 437 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  36.94 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  36.94 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  38.35 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  34.79 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.52 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  37.63 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.14 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  40.77 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  40.5 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  40.5 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  34 
 
 		 410 aa  222  9e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.58 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  45.95 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  41.05 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.55 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.46 
 
 		 379 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  37.07 
 
 		 447 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  39.23 
 
 		 419 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  40.77 
 
 		 387 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  35.56 
 
 		 407 aa  220  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  36 
 
 		 470 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  41.24 
 
 		 399 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  41.69 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  39.67 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  40.16 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  41.67 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  40 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  40.5 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  39.49 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  39.13 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  39.13 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  39.13 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  39.13 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  39.13 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  35.7 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  39.13 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.13 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  37.22 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  39.4 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  35.98 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>