More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23130 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  100 
 
 		 423 aa  843    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  51.48 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  48.55 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  47.45 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  50.12 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  50.92 
 
 		 454 aa  332  6e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  44.89 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  48.79 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  48.63 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  47.72 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  46.31 
 
 		 410 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  51.32 
 
 		 401 aa  302  9e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  43.28 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  42.65 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  48.63 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  41.9 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  42.97 
 
 		 393 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  40.83 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  41.08 
 
 		 399 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  40.05 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  40.05 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  40.73 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  38.2 
 
 		 397 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.73 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  36.52 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.69 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  39.17 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  38.93 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  36.59 
 
 		 398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  38.29 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  37.07 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.06 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  34.47 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.46 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  34.89 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.44 
 
 		 397 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  38.69 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1876  amidohydrolase  32 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  39.26 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  36.87 
 
 		 447 aa  230  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.54 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  35.64 
 
 		 381 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  37.6 
 
 		 395 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  33.73 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  37.44 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  36.89 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  35.99 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  37.2 
 
 		 439 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.62 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  34.72 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  36.64 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  38.3 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  35.89 
 
 		 381 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  38.2 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  38.2 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  34.62 
 
 		 459 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  33.33 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  35.57 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  37.08 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3041  amidohydrolase  37.2 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  37.06 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  35.22 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  36.13 
 
 		 427 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  37.27 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  33.08 
 
 		 390 aa  223  7e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.9 
 
 		 381 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  39.41 
 
 		 394 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  35.38 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1675  amidohydrolase  33.91 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  35.31 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  35.42 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  36.02 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  32.78 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  37.78 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  33.09 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  37.44 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  36.02 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  38.56 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  35.07 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  37.06 
 
 		 387 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  31.9 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  35 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  34.72 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  37.06 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  35.21 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  34.99 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  36.32 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  35.82 
 
 		 398 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.19 
 
 		 400 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  36.76 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  37.28 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.92 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  31.53 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  37.75 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  37.03 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  34.62 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  37.56 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  35.06 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  36.29 
 
 		 387 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  35.58 
 
 		 410 aa  216  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>