More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4060 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  100 
 
 
474 aa  964    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  46.7 
 
 
473 aa  431  1e-119  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  42.86 
 
 
509 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  42.13 
 
 
483 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  42.25 
 
 
492 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  42.54 
 
 
484 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  40.89 
 
 
481 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  43.64 
 
 
483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  40.97 
 
 
481 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  41.31 
 
 
482 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  41.7 
 
 
483 aa  329  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.21 
 
 
481 aa  328  9e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  40.43 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  40.43 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  40.43 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  37.5 
 
 
490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  40.22 
 
 
481 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  40.43 
 
 
481 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.21 
 
 
481 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  40.13 
 
 
481 aa  326  6e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  40.56 
 
 
475 aa  324  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  40.13 
 
 
474 aa  322  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  42.32 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  41.63 
 
 
483 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  39.11 
 
 
493 aa  316  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  41.38 
 
 
454 aa  315  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  40.38 
 
 
472 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  40.26 
 
 
472 aa  311  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  41.24 
 
 
490 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  40.89 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  40.88 
 
 
472 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  39.96 
 
 
473 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  39.69 
 
 
493 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  41.13 
 
 
471 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  39.78 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  39.23 
 
 
478 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  40.82 
 
 
471 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  34 
 
 
568 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  31.53 
 
 
400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  30.11 
 
 
401 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  36.93 
 
 
393 aa  193  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  30.75 
 
 
418 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.65 
 
 
401 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  32.74 
 
 
394 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  32.74 
 
 
394 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.75 
 
 
401 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  28.64 
 
 
392 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  30.53 
 
 
401 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  30.53 
 
 
401 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  30.53 
 
 
401 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.82 
 
 
401 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  31.18 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  30 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  31.46 
 
 
394 aa  180  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  30.62 
 
 
388 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  31.46 
 
 
395 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  31.26 
 
 
389 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  30.96 
 
 
397 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  30.18 
 
 
409 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  32.74 
 
 
387 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  37.99 
 
 
387 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  30.2 
 
 
386 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  31.63 
 
 
447 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  38.18 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  31.4 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  34.75 
 
 
414 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  35.02 
 
 
393 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  36.13 
 
 
402 aa  158  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  36.03 
 
 
402 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  35 
 
 
394 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  30.87 
 
 
392 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  34.07 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  34.07 
 
 
393 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  34.07 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  35.08 
 
 
393 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  34.56 
 
 
399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  27.41 
 
 
396 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.76 
 
 
527 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  29.85 
 
 
419 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  30.52 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  31.64 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  26.45 
 
 
527 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  34.31 
 
 
390 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  32.23 
 
 
384 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  32.34 
 
 
481 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  30.47 
 
 
441 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  32.97 
 
 
423 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  31.58 
 
 
398 aa  123  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  33.33 
 
 
408 aa  117  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  31.07 
 
 
415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  31.97 
 
 
449 aa  113  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  26.29 
 
 
439 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  27.15 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  28.39 
 
 
274 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.49 
 
 
389 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  30.42 
 
 
447 aa  90.5  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  31.42 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  30.64 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2765  amidohydrolase  31.05 
 
 
423 aa  86.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2932  amidohydrolase  27.8 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>