155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0752 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  60.04 
 
 		 527 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1088    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  27.48 
 
 		 483 aa  143  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  26.92 
 
 		 481 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  29.05 
 
 		 483 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  28.83 
 
 		 473 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  27.42 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  27.36 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  26.32 
 
 		 493 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  26.08 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  26.45 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  28 
 
 		 481 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  27.51 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  26.39 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  25.37 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  25.16 
 
 		 481 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  26.56 
 
 		 490 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  25.16 
 
 		 481 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  25.16 
 
 		 481 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  25.94 
 
 		 454 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  27.12 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  25.16 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  25.42 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  26.35 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  25.32 
 
 		 481 aa  113  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  25.42 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  24.6 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  26.34 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  26.22 
 
 		 482 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  27.45 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  25.94 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  24.32 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  25.68 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  27.72 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  24.52 
 
 		 493 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  25.82 
 
 		 568 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  27.32 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  28.83 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  29.84 
 
 		 389 aa  87.8  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  26.81 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  26.51 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  31.13 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  32.73 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  26.67 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  27.68 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  29.14 
 
 		 392 aa  76.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  26.09 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  26.09 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.67 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  26.67 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  32.73 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  24.2 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  32.12 
 
 		 402 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  27.43 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  32.19 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  22.67 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  24.7 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.71 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  33.33 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  33.33 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  40 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  33.33 
 
 		 393 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  29.52 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  31.84 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  32.24 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  26.42 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  23.68 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  28.4 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.01 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  24.71 
 
 		 387 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  27.81 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  27.81 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  28.8 
 
 		 438 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  32 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  30.14 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  29.07 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  26.44 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  26.44 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.44 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  26.44 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  26.44 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.44 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  26.63 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  30.77 
 
 		 393 aa  57  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  26.63 
 
 		 400 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  25.95 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  30.27 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  32.28 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  30.61 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  31.58 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  31.65 
 
 		 441 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1720  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  27.55 
 
 		 401 aa  53.9  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.987688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  30.32 
 
 		 405 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  28.72 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  29.34 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1411  amidohydrolase  29.07 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  29.89 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  28.85 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  25.99 
 
 		 398 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>