170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2450 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  98.71 
 
 
389 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  100 
 
 
389 aa  793    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  29.7 
 
 
388 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  30.53 
 
 
401 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  30.63 
 
 
400 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  29.49 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  28.76 
 
 
395 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  30.53 
 
 
401 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  30.53 
 
 
401 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.79 
 
 
401 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  30.53 
 
 
401 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  30.53 
 
 
401 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  30.53 
 
 
401 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.28 
 
 
401 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.53 
 
 
401 aa  166  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  32.06 
 
 
397 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  29.12 
 
 
386 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  31.55 
 
 
397 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  31.3 
 
 
447 aa  156  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  26.84 
 
 
409 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  29.07 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  29.38 
 
 
398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  27.34 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  27.34 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  25.63 
 
 
418 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  25.91 
 
 
387 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  26.36 
 
 
389 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  26.92 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  25.98 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  26.69 
 
 
387 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  26.11 
 
 
393 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  26.1 
 
 
402 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  28.06 
 
 
394 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  26.22 
 
 
414 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  26.79 
 
 
392 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  25 
 
 
384 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  25 
 
 
393 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  25 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  25 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  25.42 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  29.5 
 
 
396 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  29.19 
 
 
509 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  26.8 
 
 
447 aa  116  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  26.56 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  26.15 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  23.27 
 
 
394 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  26.4 
 
 
481 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  27.44 
 
 
481 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  28.36 
 
 
481 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  28.36 
 
 
454 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  28.36 
 
 
481 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  28.36 
 
 
481 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  28.36 
 
 
481 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  28.36 
 
 
481 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  28.36 
 
 
481 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  27.44 
 
 
481 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  23.35 
 
 
441 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  28.07 
 
 
483 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  27.24 
 
 
481 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  25.06 
 
 
419 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  24.49 
 
 
415 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.3 
 
 
274 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 
449 aa  102  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  26.71 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  26.09 
 
 
483 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  24.23 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  26.49 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  25 
 
 
403 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  24.69 
 
 
492 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  24.92 
 
 
473 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  22.86 
 
 
481 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  26.98 
 
 
482 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  25.47 
 
 
423 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  24.44 
 
 
484 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  27.36 
 
 
483 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  26.39 
 
 
472 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  27.41 
 
 
483 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  27.09 
 
 
475 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  25 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  25.64 
 
 
474 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  24.38 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  24.76 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  25 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  24.76 
 
 
490 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  24.74 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  26.27 
 
 
473 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  27.57 
 
 
493 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  24.77 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  22.9 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0436  amidohydrolase amhX  33.33 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0327  amidohydrolase amhX  33.33 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0867486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0436  amidohydrolase amhX  33.33 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0342  amidohydrolase amhX  33.33 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  25.29 
 
 
568 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0311  amidohydrolase  33.33 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0374  amidohydrolase amhX  33.33 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0314  amidohydrolase  32.64 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0170762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4929  amidohydrolase amhX  32.64 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  25.21 
 
 
490 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0389  amidohydrolase amhX  32.64 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>