More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4201 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  64.3 
 
 
481 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  70.65 
 
 
483 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  64.3 
 
 
481 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  64.09 
 
 
481 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  64.3 
 
 
481 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  64.51 
 
 
481 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  68.53 
 
 
483 aa  669    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  100 
 
 
483 aa  1007    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  63.88 
 
 
481 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  63.88 
 
 
481 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  63.67 
 
 
481 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  65.04 
 
 
454 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  55.22 
 
 
472 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  51.26 
 
 
475 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  51.67 
 
 
472 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  49.58 
 
 
482 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  48.42 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  48.21 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  47.79 
 
 
485 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  45.45 
 
 
473 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  45.57 
 
 
474 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  46.68 
 
 
472 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  45.88 
 
 
490 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  44.66 
 
 
473 aa  389  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  47.66 
 
 
471 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  42.13 
 
 
474 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  45.7 
 
 
478 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  47.18 
 
 
473 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  46.38 
 
 
471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  40.83 
 
 
481 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  42.11 
 
 
509 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  40.29 
 
 
490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  38.66 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  38.18 
 
 
493 aa  309  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  37.18 
 
 
451 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  38.31 
 
 
493 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  38.01 
 
 
483 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  33.57 
 
 
568 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  29.13 
 
 
389 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  30.6 
 
 
400 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  29.81 
 
 
401 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  33.65 
 
 
393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  30.59 
 
 
401 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  30.59 
 
 
401 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  30.59 
 
 
401 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.59 
 
 
401 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.37 
 
 
401 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  30.37 
 
 
401 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  30.37 
 
 
401 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  36.58 
 
 
447 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  30.26 
 
 
386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  29.63 
 
 
397 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.2 
 
 
447 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  33.75 
 
 
388 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  29.76 
 
 
397 aa  160  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  36.24 
 
 
387 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  35.02 
 
 
387 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  32.04 
 
 
391 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.33 
 
 
401 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  34.3 
 
 
399 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  26.79 
 
 
418 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  28.1 
 
 
409 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  27.69 
 
 
394 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  27.69 
 
 
394 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  31.58 
 
 
402 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  29.26 
 
 
395 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  26.61 
 
 
392 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  27.37 
 
 
394 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.93 
 
 
396 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  29.65 
 
 
441 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  30.61 
 
 
402 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  27.48 
 
 
527 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  32.23 
 
 
390 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  31.52 
 
 
481 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  32.21 
 
 
394 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  32.08 
 
 
392 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  31.79 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  29.72 
 
 
419 aa  134  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  31.79 
 
 
393 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  31.79 
 
 
393 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  34.18 
 
 
414 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  23.39 
 
 
425 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  31.02 
 
 
384 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  30.77 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  33.1 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  35.03 
 
 
423 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  35.69 
 
 
408 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  24.54 
 
 
527 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  28.66 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  33.71 
 
 
415 aa  108  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  26.69 
 
 
403 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  28.42 
 
 
389 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  29.5 
 
 
398 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  28.07 
 
 
389 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  29.49 
 
 
396 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  26.47 
 
 
439 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  30.54 
 
 
398 aa  87  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  29.87 
 
 
423 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  28.23 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>