More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1785 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  98.13 
 
 
481 aa  988    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  98.02 
 
 
454 aa  928    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  98.13 
 
 
481 aa  988    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  63.88 
 
 
483 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  98.75 
 
 
481 aa  993    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  98.34 
 
 
481 aa  990    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  98.13 
 
 
481 aa  988    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  100 
 
 
481 aa  1004    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  98.13 
 
 
481 aa  984    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  98.54 
 
 
481 aa  991    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  65.14 
 
 
483 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  62.71 
 
 
483 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  52.34 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  51.05 
 
 
472 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  49.58 
 
 
475 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  51.17 
 
 
482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  50.21 
 
 
481 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  47.77 
 
 
484 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  45.86 
 
 
473 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  47.55 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  45.13 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  44.35 
 
 
490 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  46.22 
 
 
472 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  46.38 
 
 
471 aa  358  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  46.96 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  46.59 
 
 
473 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  41.42 
 
 
473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  42.23 
 
 
481 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  47 
 
 
471 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  41.76 
 
 
509 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  41.21 
 
 
474 aa  323  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  39.53 
 
 
492 aa  319  7.999999999999999e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  39.51 
 
 
493 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  40.22 
 
 
490 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  39.07 
 
 
451 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  41.51 
 
 
493 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  38.6 
 
 
483 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  33.57 
 
 
568 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  35.48 
 
 
393 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  29.18 
 
 
401 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  29.46 
 
 
400 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.4 
 
 
401 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  28.38 
 
 
389 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  27.53 
 
 
418 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.93 
 
 
401 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  35.11 
 
 
401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  35.11 
 
 
401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.42 
 
 
401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  35.11 
 
 
401 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  36.14 
 
 
397 aa  162  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  34.55 
 
 
401 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  31.39 
 
 
397 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  36.64 
 
 
447 aa  160  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  30.68 
 
 
447 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  34.24 
 
 
401 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  27.98 
 
 
388 aa  156  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  35.09 
 
 
409 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  26.35 
 
 
392 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  35.44 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  31.17 
 
 
402 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  31.32 
 
 
387 aa  151  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  27.74 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.8 
 
 
396 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  29.84 
 
 
391 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  30.56 
 
 
402 aa  143  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  32.78 
 
 
387 aa  143  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  27.16 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  28.02 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  32.01 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  28.02 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  32.01 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  32.01 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  32.63 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  32.42 
 
 
394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  29.45 
 
 
441 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  32.09 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  24.38 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  33.67 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  32.65 
 
 
419 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  30.97 
 
 
393 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  35.02 
 
 
414 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  34.74 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  30.88 
 
 
384 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  33.33 
 
 
390 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 
449 aa  124  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  27.17 
 
 
481 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  25.42 
 
 
527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  35.46 
 
 
408 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  24.51 
 
 
527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  28.73 
 
 
389 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  28.36 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  33.03 
 
 
398 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  26.29 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  32.05 
 
 
415 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  30.29 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  30.29 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  30.29 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  29.64 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  29.64 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2632  amidohydrolase  28.67 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>