More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2307 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  100 
 
 		 481 aa  944    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  100 
 
 		 454 aa  945    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  99.12 
 
 		 481 aa  937    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  99.12 
 
 		 481 aa  937    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  98.24 
 
 		 481 aa  929    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  99.34 
 
 		 481 aa  941    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  100 
 
 		 481 aa  944    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  944    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  98.02 
 
 		 481 aa  928    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  65.04 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  65.63 
 
 		 483 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  62.91 
 
 		 483 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  53.41 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  51.22 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  51.25 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  52.04 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  51.48 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  47.87 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  47.99 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  46.17 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  45.5 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  47.56 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  46.1 
 
 		 490 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  47.54 
 
 		 473 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  47.39 
 
 		 471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  48.3 
 
 		 478 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  42.79 
 
 		 481 aa  348  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  48.1 
 
 		 471 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  41.99 
 
 		 473 aa  341  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  41.78 
 
 		 509 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  40.85 
 
 		 492 aa  315  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  39.55 
 
 		 493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  39.83 
 
 		 490 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  41.38 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  41.92 
 
 		 493 aa  285  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  39.68 
 
 		 451 aa  280  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  38.78 
 
 		 483 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  33.41 
 
 		 568 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  33.14 
 
 		 393 aa  182  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  29.23 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  29.96 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  27.56 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.67 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  35.11 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  35.11 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.93 
 
 		 401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.42 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  34.55 
 
 		 401 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  35.11 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  29.07 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  34.24 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  35.01 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  30.68 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  35.31 
 
 		 447 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  28.7 
 
 		 388 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  34.89 
 
 		 397 aa  156  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  34.74 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  30.86 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  32.08 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  35.69 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  26.43 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  32.11 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  30.25 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  29.52 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.75 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  32.78 
 
 		 387 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  32.35 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  31.65 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  31.65 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  31.65 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  33.33 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  33.33 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  29.88 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  32.99 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  29.85 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  33.67 
 
 		 393 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  31.72 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  27.79 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  34.66 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  34.74 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  31.91 
 
 		 384 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  30.6 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  33.33 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  27.87 
 
 		 481 aa  123  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  25.66 
 
 		 527 aa  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  35.46 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  28.73 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  28.36 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  23.84 
 
 		 527 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  26.29 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  33.97 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  32.43 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  29.06 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  29.06 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2974  aminoacylase (N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase), N-terminal  37.3 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  29.11 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  29.11 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  29.06 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>