More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3593 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  100 
 
 
408 aa  822    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  86.38 
 
 
423 aa  616  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  52.71 
 
 
403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  43.81 
 
 
393 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  43.81 
 
 
393 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  46.7 
 
 
391 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  43.56 
 
 
393 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  47.96 
 
 
415 aa  292  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  43.82 
 
 
394 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  43.38 
 
 
384 aa  262  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  40.5 
 
 
393 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  40.41 
 
 
402 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  41.18 
 
 
402 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  40.46 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  38.94 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  41.41 
 
 
399 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  38.66 
 
 
447 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  38.02 
 
 
418 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  36.76 
 
 
400 aa  225  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  37.54 
 
 
397 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  37.11 
 
 
386 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  39.84 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  35.95 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  40.57 
 
 
387 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  38.32 
 
 
388 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.1 
 
 
401 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  35.83 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  35.83 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.1 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  35.95 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  39.94 
 
 
409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  35.56 
 
 
401 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  35.56 
 
 
401 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  34.7 
 
 
425 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  38.87 
 
 
387 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  37.26 
 
 
393 aa  207  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  37.74 
 
 
395 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.95 
 
 
401 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  38.84 
 
 
447 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  36.32 
 
 
419 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  39.52 
 
 
441 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  38.28 
 
 
393 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  35.84 
 
 
414 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  29.47 
 
 
396 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  33.24 
 
 
394 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  33.24 
 
 
394 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  33.69 
 
 
389 aa  169  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  32.61 
 
 
394 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  31.02 
 
 
484 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  34.33 
 
 
481 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  28.73 
 
 
392 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  30.41 
 
 
509 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  36.55 
 
 
482 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  36.68 
 
 
481 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  33.56 
 
 
481 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  29.55 
 
 
483 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  30.32 
 
 
490 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  30.26 
 
 
474 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  30.02 
 
 
475 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  31.94 
 
 
472 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  31.03 
 
 
493 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  35.27 
 
 
483 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  31.58 
 
 
473 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  33.89 
 
 
473 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  29.67 
 
 
492 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  34.11 
 
 
490 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  30.55 
 
 
451 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  29.51 
 
 
472 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.25 
 
 
274 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  29.93 
 
 
473 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  29.3 
 
 
485 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  28.6 
 
 
472 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.46 
 
 
481 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  35.46 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  35.46 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  35.46 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  35.46 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.46 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.46 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  31.09 
 
 
398 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.46 
 
 
481 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.46 
 
 
481 aa  136  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  32.76 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  30 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  32.87 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  32.37 
 
 
483 aa  126  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  31.82 
 
 
471 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  36.2 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  31.12 
 
 
478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  28.3 
 
 
568 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  24.33 
 
 
389 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  24.33 
 
 
389 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  29.49 
 
 
402 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  27.18 
 
 
439 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  32.62 
 
 
396 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  32.62 
 
 
396 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  29.35 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  33.83 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  29.83 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>