More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4578 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  83.01 
 
 
471 aa  705    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  78.98 
 
 
472 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  100 
 
 
473 aa  948    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  82.2 
 
 
471 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  65.38 
 
 
474 aa  595  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  63.33 
 
 
473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  67.31 
 
 
478 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  56.33 
 
 
484 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  57.69 
 
 
490 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  55.9 
 
 
485 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  51.52 
 
 
472 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  50.11 
 
 
475 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  49.89 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  50.22 
 
 
481 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  45.32 
 
 
483 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  52.09 
 
 
482 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  45.89 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  45.89 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.11 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  45.89 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  45.89 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  45.68 
 
 
481 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  45.68 
 
 
481 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  47.54 
 
 
454 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  45.47 
 
 
481 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  46.14 
 
 
483 aa  352  8e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  45.91 
 
 
483 aa  349  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  42.49 
 
 
492 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  42.42 
 
 
473 aa  323  4e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  40.69 
 
 
509 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  39.78 
 
 
481 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  39.79 
 
 
474 aa  317  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  40.88 
 
 
493 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  39.39 
 
 
490 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  40.23 
 
 
483 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  41.48 
 
 
451 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  38.5 
 
 
493 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  35.73 
 
 
568 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  31.57 
 
 
400 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  31.86 
 
 
401 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  31.89 
 
 
389 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  32.25 
 
 
393 aa  186  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  32.3 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  32.08 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  32.08 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.08 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.3 
 
 
401 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  32.08 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  31.86 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.59 
 
 
401 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  31.25 
 
 
418 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  29.6 
 
 
394 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  29.48 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  29.48 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  31.06 
 
 
386 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  30.92 
 
 
402 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  33.56 
 
 
409 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  30.96 
 
 
393 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  30.96 
 
 
393 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  33 
 
 
387 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  26.29 
 
 
392 aa  156  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  30.92 
 
 
402 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  35.01 
 
 
447 aa  156  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  30.96 
 
 
393 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  32.57 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  29.08 
 
 
388 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  27.48 
 
 
425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  31.39 
 
 
391 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  31.78 
 
 
392 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  36.86 
 
 
390 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  35.41 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  27.97 
 
 
419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  31.4 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  28.79 
 
 
397 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  34.77 
 
 
394 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  35.94 
 
 
393 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  31.93 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  30.08 
 
 
397 aa  136  9e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.97 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  29.58 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  34.75 
 
 
408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  32.33 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  33.33 
 
 
481 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  24.55 
 
 
396 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  34.57 
 
 
384 aa  127  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  27.29 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.48 
 
 
274 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 
449 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  32.38 
 
 
398 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  26.4 
 
 
527 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  26.91 
 
 
403 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  29.71 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  24.22 
 
 
527 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  25.68 
 
 
389 aa  91.3  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  25.68 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  29.01 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0327  amidohydrolase amhX  27.11 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0867486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0342  amidohydrolase amhX  27.11 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0374  amidohydrolase amhX  27.46 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0311  amidohydrolase  27.11 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>