More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1298 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  100 
 
 		 389 aa  797    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  40.15 
 
 		 381 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  40.48 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.9 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  39.95 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.73 
 
 		 380 aa  273  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  39.34 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.93 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  38.92 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.52 
 
 		 386 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  38.32 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  38.68 
 
 		 381 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  38.34 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  37.6 
 
 		 392 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  36.81 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  40.51 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  38.27 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  39.89 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  36.83 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  37.66 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  37.63 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  35.7 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  36.83 
 
 		 396 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  37.73 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.43 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  34.82 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  36.96 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.58 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  36.08 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  36.55 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  34.55 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.4 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  35.1 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  36.04 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  39.31 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.1 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  39.33 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  35.31 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.01 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1059  amidohydrolase  38.13 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0752616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  36.91 
 
 		 384 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  36.43 
 
 		 395 aa  239  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1812  amidohydrolase  39.79 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  35.31 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  35.32 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  35.05 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  36.64 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13725  predicted protein  37.47 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  35.05 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  35.05 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  34.81 
 
 		 405 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  35.58 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  38.5 
 
 		 388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  35.32 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  36.2 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  36.32 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  35.81 
 
 		 398 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  33.85 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  36.08 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.07 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  37.56 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  36.15 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  35.48 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  37.27 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37.46 
 
 		 391 aa  232  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  35.66 
 
 		 390 aa  232  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  34.45 
 
 		 397 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  36.19 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  37.69 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  36.64 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  37.24 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  36.48 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  36.87 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  37.27 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  36.48 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  34.69 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  36.1 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  34.03 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  34.28 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  35.58 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  35.16 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  36.46 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  33.51 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  38.52 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  37.14 
 
 		 397 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  35.68 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  34.64 
 
 		 394 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  34.04 
 
 		 405 aa  229  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  35.81 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  37.02 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  38.35 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  34.03 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  33.25 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  35.99 
 
 		 438 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.79 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  36.14 
 
 		 449 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.68 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  34.28 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  34.37 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  35.52 
 
 		 435 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>