More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1059 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1059  amidohydrolase  100 
 
 
391 aa  803    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0752616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1434  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.92 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1002  amidohydrolase family protein  37.97 
 
 
408 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000070505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  36 
 
 
405 aa  252  7e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  38.13 
 
 
389 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  37.5 
 
 
390 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  32.58 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  34.95 
 
 
449 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.95 
 
 
380 aa  230  4e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0090  amidohydrolase  37.34 
 
 
392 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0093  amidohydrolase  37.34 
 
 
392 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  36.13 
 
 
391 aa  229  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  36.9 
 
 
390 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  34.84 
 
 
398 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  34.68 
 
 
405 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  34.57 
 
 
398 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  35.51 
 
 
400 aa  227  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  36.06 
 
 
400 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  34.08 
 
 
396 aa  226  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  34.81 
 
 
449 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  35.71 
 
 
391 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  34.02 
 
 
393 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  33.42 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  34.79 
 
 
394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.8 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  37.67 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  37.97 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  35.75 
 
 
381 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.53 
 
 
394 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  32.44 
 
 
405 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1139  amidohydrolase  35.97 
 
 
385 aa  217  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  33.5 
 
 
447 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  34.5 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  35.05 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  35.26 
 
 
413 aa  216  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  33.42 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  32.84 
 
 
459 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  35.77 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  33.5 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  35.66 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  34.4 
 
 
397 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  35.49 
 
 
381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.86 
 
 
401 aa  213  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  32.29 
 
 
387 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  32.97 
 
 
408 aa  212  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  33.77 
 
 
398 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  33.77 
 
 
398 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  36.03 
 
 
387 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  34.28 
 
 
395 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  34.82 
 
 
438 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  31.99 
 
 
405 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  35.35 
 
 
400 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  32.61 
 
 
403 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  32.61 
 
 
403 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  35.13 
 
 
403 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  35.29 
 
 
393 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  35.42 
 
 
395 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  34.93 
 
 
397 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  34.03 
 
 
381 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  35.69 
 
 
372 aa  209  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  35.86 
 
 
387 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  33.33 
 
 
385 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  35.2 
 
 
395 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  35.86 
 
 
387 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  35.63 
 
 
381 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  33.33 
 
 
385 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  34.29 
 
 
384 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  32.9 
 
 
389 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  34.99 
 
 
384 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.58 
 
 
381 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  32.2 
 
 
396 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  34.03 
 
 
391 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  36.24 
 
 
387 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.43 
 
 
394 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  33.33 
 
 
385 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  34.03 
 
 
391 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  36.24 
 
 
387 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  35.51 
 
 
390 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  36.36 
 
 
387 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  35.68 
 
 
399 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  34.2 
 
 
425 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  36.36 
 
 
387 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  33.66 
 
 
395 aa  206  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  36.27 
 
 
423 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  33.33 
 
 
435 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  35.73 
 
 
396 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  34.22 
 
 
379 aa  205  9e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  34.19 
 
 
385 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  32.21 
 
 
389 aa  205  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  35.45 
 
 
381 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  34.06 
 
 
404 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  35.47 
 
 
396 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  34.55 
 
 
397 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  35.66 
 
 
398 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  32.23 
 
 
400 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  33.16 
 
 
388 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  34.19 
 
 
400 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  34.5 
 
 
406 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  33.67 
 
 
396 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  32.64 
 
 
395 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>