More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1434 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1434  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  100 
 
 
395 aa  809    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1059  amidohydrolase  41.92 
 
 
391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0752616  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  37.43 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  38.32 
 
 
400 aa  247  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1002  amidohydrolase family protein  35.71 
 
 
408 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000070505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  35.61 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  36.22 
 
 
400 aa  229  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  34.51 
 
 
398 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  34.51 
 
 
398 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  31.62 
 
 
393 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.05 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  35.37 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  32.27 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  33.78 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  33.07 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  33.51 
 
 
403 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  33.52 
 
 
399 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  33.84 
 
 
390 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  34.34 
 
 
389 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  33.84 
 
 
396 aa  209  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  31.31 
 
 
394 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  33.67 
 
 
396 aa  206  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  32.99 
 
 
397 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  33.59 
 
 
396 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  34.54 
 
 
388 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  33.42 
 
 
396 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1876  amidohydrolase  32.82 
 
 
389 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  33.16 
 
 
396 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  31.33 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  31.2 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  33.06 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  31.97 
 
 
397 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  33.15 
 
 
405 aa  199  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  34.04 
 
 
415 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  33.15 
 
 
393 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  34.04 
 
 
415 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  33.07 
 
 
390 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  34.04 
 
 
396 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  31.47 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  33.25 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  30.53 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  33.16 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  32.14 
 
 
400 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  32.44 
 
 
408 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  33.16 
 
 
400 aa  196  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  33.16 
 
 
399 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  34.5 
 
 
396 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  35.51 
 
 
391 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  33.85 
 
 
387 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  31.46 
 
 
395 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  33.07 
 
 
379 aa  193  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0220  amidohydrolase  32.65 
 
 
389 aa  192  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  30.65 
 
 
402 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  34.55 
 
 
395 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  33.51 
 
 
388 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  32.08 
 
 
396 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  31.87 
 
 
396 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  32.99 
 
 
395 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  32.56 
 
 
401 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  32.07 
 
 
386 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  32.31 
 
 
398 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  31.61 
 
 
404 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  34.04 
 
 
399 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  31.7 
 
 
392 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  31.57 
 
 
399 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  32.74 
 
 
405 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2126  peptidase M20D, amidohydrolase  35.4 
 
 
390 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.587793  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  31.79 
 
 
423 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  32.56 
 
 
401 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  31.27 
 
 
387 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  30.39 
 
 
388 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.54 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  31.78 
 
 
397 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  30.67 
 
 
394 aa  189  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  31.97 
 
 
385 aa  190  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  34.88 
 
 
388 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  31.3 
 
 
381 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  33.25 
 
 
390 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  31.95 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  34.39 
 
 
396 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.9 
 
 
401 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  31.47 
 
 
381 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  31.54 
 
 
381 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  32.28 
 
 
394 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  32.6 
 
 
386 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  31.04 
 
 
405 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  32.01 
 
 
394 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  31.37 
 
 
381 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  32.49 
 
 
408 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  32.38 
 
 
396 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  32.38 
 
 
396 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  32.01 
 
 
394 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  32.38 
 
 
396 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  31.5 
 
 
399 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  31.36 
 
 
397 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  33.42 
 
 
389 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  32.38 
 
 
396 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  32.38 
 
 
396 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  32.38 
 
 
396 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  30.03 
 
 
407 aa  186  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>