More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3053 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  93.53 
 
 		 402 aa  713    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  100 
 
 		 402 aa  798    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  61.46 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  57.89 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  56.05 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  57.63 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  56.05 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  56.05 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  53.44 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  56.51 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  48.77 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  42.06 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  46.18 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  45.97 
 
 		 415 aa  249  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  39.78 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  40.78 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  37.75 
 
 		 419 aa  243  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.78 
 
 		 447 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  42.63 
 
 		 403 aa  242  7e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  43.95 
 
 		 409 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  38.32 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  40.74 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  33.51 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  41.14 
 
 		 447 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  40.58 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  31.7 
 
 		 394 aa  219  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  31.7 
 
 		 394 aa  219  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  32.23 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  33.6 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  36.55 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  37.89 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  38.89 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  31.71 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  34.22 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  35.77 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  38.1 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  31.71 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.9 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  31.71 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  31.46 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  31.71 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.71 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.71 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  31.46 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  31.46 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  35.07 
 
 		 389 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  30.2 
 
 		 392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  38.85 
 
 		 441 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  40.73 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  32.98 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  30.41 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  34.93 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  27.76 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  27.72 
 
 		 492 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  27.42 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  33.13 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  32.89 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  29.27 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  27.51 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  30.65 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  27.39 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  30.12 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  30.61 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  31.64 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  28.4 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  34.93 
 
 		 474 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  27.69 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  30.87 
 
 		 473 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  30.61 
 
 		 473 aa  140  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  30.25 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  30.25 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  30.25 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  32.17 
 
 		 475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  30.25 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  30.25 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  30.25 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  33.46 
 
 		 485 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  30.25 
 
 		 481 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  30.25 
 
 		 481 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  30.25 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  31.16 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  34.59 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  31.56 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  34.59 
 
 		 482 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  33.12 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  32.59 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  29.64 
 
 		 493 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  28.32 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  32.2 
 
 		 483 aa  126  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  34.38 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  31.49 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.78 
 
 		 274 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  32.63 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  30.5 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  28.3 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  30.05 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  30.85 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  28.8 
 
 		 393 aa  97.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  29.14 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>