More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3876 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  96.9 
 
 		 485 aa  944    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  100 
 
 		 484 aa  1001    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  64.09 
 
 		 490 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  57.76 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  54.64 
 
 		 473 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  57.88 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  57.37 
 
 		 473 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  53.98 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  50.84 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  49.79 
 
 		 482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  56.55 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  48.21 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  54.98 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  55.22 
 
 		 471 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  50.74 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  50.42 
 
 		 475 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  47.13 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  47.35 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  47.13 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  47.13 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  47.35 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.92 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  47.13 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  47.35 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  50.21 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  48.66 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  47.87 
 
 		 454 aa  405  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  43.9 
 
 		 509 aa  359  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  42.34 
 
 		 473 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  42.54 
 
 		 474 aa  338  9e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  42.19 
 
 		 481 aa  334  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  41.51 
 
 		 492 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  42.7 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  40.49 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  40.05 
 
 		 493 aa  299  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  39.7 
 
 		 493 aa  286  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  38.25 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  36.78 
 
 		 568 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  32.68 
 
 		 393 aa  212  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  32.47 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  32.74 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  33.18 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  33.18 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.41 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.41 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  33.18 
 
 		 401 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  32.35 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  32.82 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  31.45 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  32.74 
 
 		 401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.29 
 
 		 401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  31.51 
 
 		 388 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  34.8 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  32.9 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  29.36 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  33.08 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  28.9 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  30.96 
 
 		 386 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  33.95 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  28.9 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  28.9 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  32.49 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  29.49 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  29.49 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  32.81 
 
 		 387 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  37.05 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  34.93 
 
 		 402 aa  156  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  36.21 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  34.83 
 
 		 391 aa  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  32.01 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  33.69 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.25 
 
 		 447 aa  150  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  31.15 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  27.82 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  34.55 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  35.06 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  31.85 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  31.08 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  29.53 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  35.77 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  33.12 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  29.13 
 
 		 481 aa  136  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  27.19 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  25.79 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  33.45 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  35.85 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.7 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  27.6 
 
 		 403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  26.39 
 
 		 527 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  33.57 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  23.85 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  27.89 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  26.87 
 
 		 439 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  24.44 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  24.44 
 
 		 389 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  32.07 
 
 		 397 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  30.14 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0327  amidohydrolase amhX  29.66 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0867486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0374  amidohydrolase amhX  29.28 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>