216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4763 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  100 
 
 
568 aa  1169    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  38.82 
 
 
473 aa  300  4e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  36.44 
 
 
481 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  39.47 
 
 
483 aa  293  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  35.16 
 
 
509 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  36.23 
 
 
484 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  35.37 
 
 
493 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  34.32 
 
 
492 aa  251  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  32.36 
 
 
483 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  34.48 
 
 
473 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  36.29 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  35.62 
 
 
474 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  33.85 
 
 
474 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  34.68 
 
 
490 aa  233  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  33.77 
 
 
493 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  32.36 
 
 
481 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  33.12 
 
 
454 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  32.36 
 
 
481 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.36 
 
 
481 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.36 
 
 
481 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  32.01 
 
 
490 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.15 
 
 
481 aa  223  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  32.09 
 
 
451 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  34.19 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.28 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  32.15 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.49 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  35.78 
 
 
481 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  33.11 
 
 
472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  35.8 
 
 
483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  36.38 
 
 
483 aa  209  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  33.8 
 
 
475 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  35.97 
 
 
471 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  35.36 
 
 
473 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  32.34 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  33.19 
 
 
482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  36.07 
 
 
478 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  35.89 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  27.27 
 
 
393 aa  160  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  28.57 
 
 
409 aa  137  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  27.68 
 
 
397 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  27.25 
 
 
388 aa  130  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  26.82 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  30.38 
 
 
387 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.73 
 
 
447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  26.73 
 
 
397 aa  128  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  25.78 
 
 
387 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  29.69 
 
 
389 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  27.25 
 
 
418 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  29.56 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  27.3 
 
 
447 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  25.61 
 
 
401 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  25.56 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  23.97 
 
 
392 aa  113  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.28 
 
 
401 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  26.06 
 
 
401 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  26.06 
 
 
401 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  28.81 
 
 
393 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.63 
 
 
401 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.06 
 
 
401 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  25.84 
 
 
401 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  26.1 
 
 
441 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  25.84 
 
 
401 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  30.77 
 
 
414 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  25.61 
 
 
401 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  27.2 
 
 
393 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  30.37 
 
 
423 aa  100  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  26.13 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  27.27 
 
 
391 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  29.21 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  27.71 
 
 
481 aa  98.2  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  26.76 
 
 
425 aa  97.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  24.34 
 
 
402 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  25.32 
 
 
527 aa  95.9  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  26.52 
 
 
402 aa  94.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  26.26 
 
 
394 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  25.08 
 
 
393 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  24.42 
 
 
527 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  28.29 
 
 
392 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  24.76 
 
 
393 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  24.76 
 
 
393 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  24.6 
 
 
394 aa  91.7  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  24.38 
 
 
394 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  24.38 
 
 
394 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  27.04 
 
 
390 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  30.27 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  24.52 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  23.22 
 
 
396 aa  82  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  28.77 
 
 
403 aa  80.1  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  28.3 
 
 
408 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  23.74 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.23 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  23.96 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  23.96 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  26.17 
 
 
415 aa  67  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1379  amidohydrolase  23.43 
 
 
427 aa  67  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2765  amidohydrolase  24.8 
 
 
423 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0512  peptidase M20D, amidohydrolase  32.86 
 
 
379 aa  62.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  23.94 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>