More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4200 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  76.16 
 
 
443 aa  669    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0516  amidohydrolase  74.07 
 
 
441 aa  662    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  100 
 
 
438 aa  905    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1985  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  65.89 
 
 
436 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.556014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01315  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  65.65 
 
 
436 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2306  amidohydrolase  65.65 
 
 
436 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.696585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1454  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  65.65 
 
 
436 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1784  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  64.95 
 
 
433 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01325  hypothetical protein  65.65 
 
 
436 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1550  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  65.65 
 
 
436 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2287  amidohydrolase  65.65 
 
 
436 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.965189  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1106  amidohydrolase family protein  41.12 
 
 
432 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1287  amidohydrolase family protein  40.89 
 
 
432 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0904726  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3989  amidohydrolase  44.88 
 
 
426 aa  361  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0745  amidohydrolase  41.84 
 
 
437 aa  343  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1411  amidohydrolase  44.15 
 
 
426 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2932  amidohydrolase  40.47 
 
 
426 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2071  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  41.15 
 
 
438 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1379  amidohydrolase  42.17 
 
 
427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4154  amidohydrolase  37.15 
 
 
427 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0797  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  37.88 
 
 
439 aa  309  5e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1243  M20/M25/M40 family peptidase  40.43 
 
 
421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2765  amidohydrolase  41.67 
 
 
423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3779  amidohydrolase  38.86 
 
 
426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0880  amidohydrolase  38.88 
 
 
424 aa  299  7e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1057  amidohydrolase  39.16 
 
 
426 aa  286  4e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3128  amidohydrolase  40.48 
 
 
423 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1053  amidohydrolase  37.93 
 
 
440 aa  279  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3766  amidohydrolase  37.93 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2938  amidohydrolase  36.17 
 
 
460 aa  259  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  31.48 
 
 
405 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  29.33 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  29.33 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  29.51 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  29.4 
 
 
405 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  30.37 
 
 
408 aa  170  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  28.44 
 
 
387 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  30.59 
 
 
404 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  30.7 
 
 
404 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  28.37 
 
 
405 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  28.67 
 
 
459 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  27.29 
 
 
449 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  32.03 
 
 
399 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  27.94 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  29.55 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  29.76 
 
 
384 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  26.36 
 
 
480 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  29.04 
 
 
406 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  28.85 
 
 
449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  29.91 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  29.91 
 
 
395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  28.14 
 
 
396 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  27.06 
 
 
387 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  25.17 
 
 
423 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  29.52 
 
 
396 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  28.54 
 
 
389 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  29.15 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  29.15 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  29.74 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  29.58 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  29.15 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  30.14 
 
 
396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2454  amidohydrolase  26.35 
 
 
394 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  26.74 
 
 
386 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  29.12 
 
 
389 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  25.68 
 
 
390 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  28.96 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  27.98 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  29.02 
 
 
397 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  27.05 
 
 
432 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  27.76 
 
 
387 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  30.5 
 
 
390 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  28.73 
 
 
395 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  27.59 
 
 
396 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  28.85 
 
 
388 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  29.37 
 
 
394 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  29.37 
 
 
394 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  29.37 
 
 
394 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  29.66 
 
 
390 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  24.26 
 
 
393 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  29.46 
 
 
394 aa  137  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  28.95 
 
 
392 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  28.97 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  27.7 
 
 
415 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  29.38 
 
 
387 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  30.46 
 
 
395 aa  136  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  29.45 
 
 
396 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  29.45 
 
 
396 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.45 
 
 
396 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  29.45 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  29.45 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  26.71 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  28.6 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  29.45 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  27.27 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  29.45 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  31.29 
 
 
458 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  28.71 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  28.9 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  29.1 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>