More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1287 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1287  amidohydrolase family protein  100 
 
 
432 aa  883    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0904726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1106  amidohydrolase family protein  96.53 
 
 
432 aa  854    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  40.89 
 
 
438 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0516  amidohydrolase  43.3 
 
 
441 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1411  amidohydrolase  42.21 
 
 
426 aa  354  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2765  amidohydrolase  42.42 
 
 
423 aa  350  4e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1550  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  40.42 
 
 
436 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1454  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  40.42 
 
 
436 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2287  amidohydrolase  40.42 
 
 
436 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.965189  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  40.56 
 
 
443 aa  345  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3779  amidohydrolase  39.06 
 
 
426 aa  344  2e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01315  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  40.19 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2306  amidohydrolase  40.19 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.696585  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01325  hypothetical protein  40.19 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1784  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  39.95 
 
 
433 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1985  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  39.95 
 
 
436 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2932  amidohydrolase  38.59 
 
 
426 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1379  amidohydrolase  40.66 
 
 
427 aa  339  5e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3766  amidohydrolase  39.43 
 
 
451 aa  329  7e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3989  amidohydrolase  38.55 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1053  amidohydrolase  39.24 
 
 
440 aa  323  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1243  M20/M25/M40 family peptidase  42.21 
 
 
421 aa  323  4e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0745  amidohydrolase  43.29 
 
 
437 aa  322  8e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0880  amidohydrolase  38.64 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4154  amidohydrolase  39.42 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2938  amidohydrolase  39.05 
 
 
460 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2071  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  41.31 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0797  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  41.26 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1057  amidohydrolase  38.35 
 
 
426 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3128  amidohydrolase  38.81 
 
 
423 aa  306  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  27.83 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  30.37 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  26.15 
 
 
403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  26.15 
 
 
403 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  26.3 
 
 
386 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  26.07 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  27.27 
 
 
391 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  27.33 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  27.83 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.05 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  26.73 
 
 
408 aa  136  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  25.98 
 
 
405 aa  136  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.73 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.73 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  27.11 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  26.62 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  27.7 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  27.8 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  26.77 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  27.25 
 
 
480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  26.76 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.02 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  25.91 
 
 
405 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  25.62 
 
 
389 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  26.39 
 
 
438 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  27.03 
 
 
388 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  26.67 
 
 
415 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  25.95 
 
 
388 aa  132  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  26.82 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  26.36 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.82 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  27.66 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  27.05 
 
 
388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  25.4 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  25.67 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  27.73 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  27.71 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  25.29 
 
 
385 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  25.61 
 
 
399 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  25.87 
 
 
389 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  26.92 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  24.72 
 
 
405 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  25.77 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  26.68 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  25.28 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  27.23 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  26.27 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  28.18 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  27 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  26.07 
 
 
396 aa  126  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  26.08 
 
 
390 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  24.6 
 
 
430 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  26.42 
 
 
392 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  26.9 
 
 
383 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  27.4 
 
 
389 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  27.48 
 
 
393 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  28.22 
 
 
449 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  27.83 
 
 
396 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  29.14 
 
 
393 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  28.27 
 
 
466 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  25.58 
 
 
387 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  28.95 
 
 
379 aa  124  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.4 
 
 
389 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  27.6 
 
 
396 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  24.09 
 
 
400 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  28.57 
 
 
465 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  27.19 
 
 
382 aa  123  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0803  hippurate hydrolase  26.67 
 
 
383 aa  122  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  28.53 
 
 
465 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  26.86 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>