More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01315 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01315  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  100 
 
 
436 aa  892    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2306  amidohydrolase  100 
 
 
436 aa  892    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.696585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1454  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  99.31 
 
 
436 aa  887    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2287  amidohydrolase  99.31 
 
 
436 aa  887    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.965189  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1985  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  98.85 
 
 
436 aa  884    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1550  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  99.31 
 
 
436 aa  887    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1784  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  98.15 
 
 
433 aa  875    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01325  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  892    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  65.65 
 
 
438 aa  584  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0516  amidohydrolase  63.55 
 
 
441 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  64.17 
 
 
443 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1287  amidohydrolase family protein  40.19 
 
 
432 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0904726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1106  amidohydrolase family protein  39.81 
 
 
432 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1243  M20/M25/M40 family peptidase  43.49 
 
 
421 aa  335  9e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0745  amidohydrolase  39.91 
 
 
437 aa  328  9e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2071  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  41.9 
 
 
438 aa  324  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3989  amidohydrolase  41.16 
 
 
426 aa  319  7e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0797  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  38.76 
 
 
439 aa  311  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2932  amidohydrolase  39.23 
 
 
426 aa  292  8e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4154  amidohydrolase  37.74 
 
 
427 aa  292  9e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0880  amidohydrolase  39.04 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1411  amidohydrolase  38.76 
 
 
426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2765  amidohydrolase  37.53 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1057  amidohydrolase  38.63 
 
 
426 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3779  amidohydrolase  37.62 
 
 
426 aa  274  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1379  amidohydrolase  39.18 
 
 
427 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3128  amidohydrolase  38.76 
 
 
423 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1053  amidohydrolase  36.5 
 
 
440 aa  259  6e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3766  amidohydrolase  37.56 
 
 
451 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2938  amidohydrolase  35.51 
 
 
460 aa  249  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  31.34 
 
 
405 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  30.41 
 
 
405 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  31.11 
 
 
403 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  31.11 
 
 
403 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  30.02 
 
 
387 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  31.26 
 
 
405 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  31.03 
 
 
399 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  32.5 
 
 
404 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  35.08 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  28.9 
 
 
405 aa  163  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  27.05 
 
 
423 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  31.6 
 
 
396 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  29.64 
 
 
396 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  29.21 
 
 
396 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  30.41 
 
 
395 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  31.4 
 
 
398 aa  156  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  30.39 
 
 
404 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  28.94 
 
 
395 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  29.93 
 
 
396 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  28.5 
 
 
386 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  29.81 
 
 
408 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  26.92 
 
 
480 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  28.73 
 
 
449 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  30.25 
 
 
399 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  29.11 
 
 
395 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  31.84 
 
 
394 aa  150  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  29.11 
 
 
395 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  28.87 
 
 
395 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  29.11 
 
 
395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  26.74 
 
 
390 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  25.18 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  30.7 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  30.82 
 
 
389 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  30.46 
 
 
402 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  28.27 
 
 
449 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  29.13 
 
 
393 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  28.04 
 
 
388 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  29.57 
 
 
406 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.04 
 
 
381 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  28.17 
 
 
381 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  30.91 
 
 
388 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  31.36 
 
 
400 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  26.42 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  28.47 
 
 
387 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  29.27 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  28.67 
 
 
392 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  28.31 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  29.77 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  28.4 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  29.74 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  26.49 
 
 
432 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  29.52 
 
 
381 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  29.2 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  30.68 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  28.47 
 
 
390 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3370  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase) (hippuricase)  31.55 
 
 
343 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  28.38 
 
 
459 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  27.93 
 
 
381 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  28.88 
 
 
386 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  25.64 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3967  amidohydrolase  29.21 
 
 
387 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105311  normal  0.023009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  27.31 
 
 
387 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  27.78 
 
 
380 aa  136  9e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  29.01 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  29.4 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  28.98 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  28.26 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  30.09 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  30.48 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  29.4 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>