More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0516 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0516  amidohydrolase  100 
 
 
441 aa  908    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  74.07 
 
 
438 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  86.39 
 
 
443 aa  761    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01315  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  63.55 
 
 
436 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2306  amidohydrolase  63.55 
 
 
436 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.696585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1985  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  63.55 
 
 
436 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01325  hypothetical protein  63.55 
 
 
436 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1550  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  63.32 
 
 
436 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1454  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  63.32 
 
 
436 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1784  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  63.47 
 
 
433 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2287  amidohydrolase  63.32 
 
 
436 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.965189  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1106  amidohydrolase family protein  43.36 
 
 
432 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1287  amidohydrolase family protein  43.3 
 
 
432 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0904726  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3989  amidohydrolase  43.23 
 
 
426 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0745  amidohydrolase  42.72 
 
 
437 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1411  amidohydrolase  45.12 
 
 
426 aa  332  9e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1243  M20/M25/M40 family peptidase  43.31 
 
 
421 aa  322  9.000000000000001e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2071  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  41.76 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1379  amidohydrolase  41.93 
 
 
427 aa  310  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2765  amidohydrolase  42.37 
 
 
423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2932  amidohydrolase  39.62 
 
 
426 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4154  amidohydrolase  38.03 
 
 
427 aa  306  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0797  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  39.05 
 
 
439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0880  amidohydrolase  41.18 
 
 
424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3766  amidohydrolase  40.85 
 
 
451 aa  300  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3779  amidohydrolase  38.97 
 
 
426 aa  295  8e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1053  amidohydrolase  38.03 
 
 
440 aa  279  6e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1057  amidohydrolase  38.83 
 
 
426 aa  277  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2938  amidohydrolase  38.37 
 
 
460 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3128  amidohydrolase  39.02 
 
 
423 aa  276  7e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  31.84 
 
 
399 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  29.07 
 
 
405 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  29.23 
 
 
405 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  30.02 
 
 
405 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  30.23 
 
 
404 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  28.28 
 
 
403 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  28.28 
 
 
403 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  28.37 
 
 
405 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  31.12 
 
 
390 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  28.57 
 
 
386 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  25.51 
 
 
393 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  28.88 
 
 
408 aa  152  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  27.57 
 
 
387 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  26.74 
 
 
423 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  26.22 
 
 
480 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  30.71 
 
 
406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  28.54 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  28.32 
 
 
459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  30.84 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  27.02 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  27.63 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  30.82 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  30.48 
 
 
388 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  28.7 
 
 
402 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  28.84 
 
 
399 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  27.79 
 
 
404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  28.94 
 
 
384 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  29.23 
 
 
399 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  29.28 
 
 
395 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  27.75 
 
 
394 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  29.34 
 
 
387 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  27.75 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  30.77 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  27.59 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  31.26 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  28.41 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  31.26 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  29.89 
 
 
396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  28.77 
 
 
388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  30.3 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  30.3 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  29.57 
 
 
396 aa  141  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  28.84 
 
 
389 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  31.26 
 
 
387 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  28.34 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  29.25 
 
 
389 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  28.24 
 
 
394 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  28.24 
 
 
394 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  28.47 
 
 
394 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  27.02 
 
 
447 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  25.52 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  26.84 
 
 
458 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  29.93 
 
 
405 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  28.71 
 
 
387 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  31.4 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  29.69 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  29.07 
 
 
396 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  29.97 
 
 
387 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  25.41 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  27.35 
 
 
438 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  28.01 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  27.29 
 
 
379 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  27.16 
 
 
387 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  29.41 
 
 
393 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  29.44 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  29.33 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  28.57 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  29.56 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  29.47 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  29.44 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>