More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1106 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1287  amidohydrolase family protein  96.53 
 
 
432 aa  854    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0904726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1106  amidohydrolase family protein  100 
 
 
432 aa  881    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  41.12 
 
 
438 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0516  amidohydrolase  43.46 
 
 
441 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  41.26 
 
 
443 aa  351  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1411  amidohydrolase  41.97 
 
 
426 aa  346  5e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2287  amidohydrolase  40.05 
 
 
436 aa  343  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.965189  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1454  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  40.05 
 
 
436 aa  343  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1550  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  40.05 
 
 
436 aa  343  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01315  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  39.81 
 
 
436 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2306  amidohydrolase  39.81 
 
 
436 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.696585  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01325  hypothetical protein  39.81 
 
 
436 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2765  amidohydrolase  41.37 
 
 
423 aa  341  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1985  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  39.58 
 
 
436 aa  338  9e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.556014 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1784  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  39.35 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1379  amidohydrolase  40.19 
 
 
427 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3779  amidohydrolase  39.56 
 
 
426 aa  333  4e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2932  amidohydrolase  37.97 
 
 
426 aa  332  9e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3989  amidohydrolase  37.83 
 
 
426 aa  325  1e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0745  amidohydrolase  43.06 
 
 
437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4154  amidohydrolase  38.69 
 
 
427 aa  316  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2071  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  41.88 
 
 
438 aa  315  8e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0797  aminobenzoyl-glutamate utilization protein A  41.88 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3766  amidohydrolase  37.77 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1243  M20/M25/M40 family peptidase  41.01 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0880  amidohydrolase  37.7 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.555693  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1053  amidohydrolase  37.59 
 
 
440 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2938  amidohydrolase  37.86 
 
 
460 aa  309  8e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1057  amidohydrolase  37.18 
 
 
426 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3128  amidohydrolase  37.62 
 
 
423 aa  296  3e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.377717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  27.83 
 
 
423 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  30.14 
 
 
390 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  25.46 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  25.46 
 
 
403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  24.66 
 
 
405 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  25.63 
 
 
386 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  26.91 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  26.55 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  25.29 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  25.63 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  27.96 
 
 
393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  27.46 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  26.88 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  27.95 
 
 
381 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  25.78 
 
 
391 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  27.36 
 
 
391 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  25.73 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.68 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  27.27 
 
 
480 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  26.32 
 
 
387 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.46 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.46 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  27.47 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  26.08 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.23 
 
 
391 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  25.55 
 
 
404 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  25.34 
 
 
389 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  25.97 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  29.77 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  26.23 
 
 
391 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.23 
 
 
391 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  25.51 
 
 
403 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  27 
 
 
399 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  26.73 
 
 
399 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  24.16 
 
 
405 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  30.63 
 
 
388 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  26.11 
 
 
400 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  25.88 
 
 
399 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  26.23 
 
 
391 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  25.46 
 
 
389 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  28.85 
 
 
379 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  25.45 
 
 
390 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  25.17 
 
 
399 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  25.87 
 
 
415 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  26.62 
 
 
381 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  24.94 
 
 
388 aa  123  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  25.42 
 
 
389 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  26.68 
 
 
391 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  26.47 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  26.21 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  25.52 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  28.27 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  26.24 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  24.14 
 
 
430 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  25.62 
 
 
390 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  26.14 
 
 
387 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  28.57 
 
 
465 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  25.6 
 
 
407 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  29.45 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  25.72 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  28.53 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  25.9 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  25.9 
 
 
381 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  28.65 
 
 
435 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  25.4 
 
 
387 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  24.77 
 
 
404 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  26.27 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  26.41 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  25.42 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  27.52 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>