43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5064 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  272  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  52.1 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  52.1 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  39.17 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  32.48 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  31.36 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  32.74 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  32.74 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  32.74 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  31.86 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  31.93 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5075  hypothetical protein  33.08 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  30.25 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  32.74 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  28.81 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  29.66 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  29.03 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  27.73 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  29.23 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  28.07 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  27.5 
 
 		 287 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  28.07 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  28.07 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  28.07 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  25.49 
 
 		 254 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  28.07 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  28.07 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  28.21 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  28.03 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  28.95 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  27.43 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  28.95 
 
 		 158 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  28.95 
 
 		 158 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  25.86 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  28.07 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  28.93 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  28.79 
 
 		 142 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  27.97 
 
 		 255 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  28.93 
 
 		 253 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  27.56 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  25.86 
 
 		 253 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  26.96 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>