More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5012 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5012  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6396  ABC transporter related  83.14 
 
 		 259 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784056  normal  0.338935 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4530  ABC transporter related  82.28 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0252344  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5070  ABC transporter related  75.5 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.4 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  66.94 
 
 		 256 aa  342  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  66.26 
 
 		 254 aa  342  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  65.85 
 
 		 254 aa  341  5.999999999999999e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  64 
 
 		 265 aa  340  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  64.4 
 
 		 268 aa  339  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  70 
 
 		 256 aa  338  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1957  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, ATP-binding component  69.6 
 
 		 256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  67.48 
 
 		 257 aa  338  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  67.22 
 
 		 256 aa  338  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  66.26 
 
 		 264 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  63.2 
 
 		 265 aa  337  8e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01549  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.6 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 257 aa  334  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  66.4 
 
 		 258 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 		 257 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  66.67 
 
 		 257 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  66.26 
 
 		 257 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  63.31 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  65.45 
 
 		 257 aa  331  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  63.56 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  65.86 
 
 		 264 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  65.06 
 
 		 259 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0176  ABC transporter related  66.8 
 
 		 257 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  64.66 
 
 		 263 aa  329  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  65.06 
 
 		 259 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  65.85 
 
 		 263 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  65.46 
 
 		 264 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  63.86 
 
 		 259 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.86 
 
 		 255 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.86 
 
 		 255 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.86 
 
 		 255 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.86 
 
 		 255 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  65.06 
 
 		 263 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 		 259 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  65.46 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  65.46 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  64.66 
 
 		 259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  66.53 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  65.46 
 
 		 255 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64.66 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  64.66 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  64.66 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  64.66 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  64.8 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  64.66 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  65.31 
 
 		 264 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  63.86 
 
 		 259 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  63.86 
 
 		 259 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 		 259 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.66 
 
 		 255 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  64.78 
 
 		 260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  62.65 
 
 		 261 aa  325  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.26 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  63.45 
 
 		 259 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  63.86 
 
 		 273 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  64.9 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  64.9 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  64.9 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  65.6 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  64.9 
 
 		 274 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  65.6 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  64.9 
 
 		 266 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  64.49 
 
 		 266 aa  321  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0306  ABC transporter related  65.45 
 
 		 257 aa  321  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0328197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4927  ABC transporter related  65.04 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000746315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0301  ABC transporter related  65.45 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  0.0971272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0283  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.04 
 
 		 257 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  63.35 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  65.85 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  65.85 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  66.67 
 
 		 260 aa  315  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5620  ABC transporter related  65.45 
 
 		 263 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33769  normal  0.48153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  65.45 
 
 		 263 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 		 275 aa  314  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  65.85 
 
 		 263 aa  314  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  63.82 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26210  ATP-binding component of histidine transport  66.53 
 
 		 255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0271347  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  63.75 
 
 		 265 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 257 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  63.75 
 
 		 265 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  63.35 
 
 		 265 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  63.2 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  60.96 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  60 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  62.4 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  62.4 
 
 		 254 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  61.6 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  61.6 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  62 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  60.56 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2221  putative amino acid ABC transporter  62.45 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  63.01 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1521  ABC transporter related  63.89 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>