More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1090 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  520  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  91.34 
 
 		 254 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  88.19 
 
 		 254 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  88.98 
 
 		 254 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  89.37 
 
 		 254 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  87.4 
 
 		 254 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  87.4 
 
 		 254 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  87.4 
 
 		 254 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  87.8 
 
 		 254 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  86.61 
 
 		 254 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  86.61 
 
 		 254 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  73.02 
 
 		 257 aa  387  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  73.12 
 
 		 259 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  72.73 
 
 		 259 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  73.12 
 
 		 259 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  72.73 
 
 		 259 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  72.73 
 
 		 259 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  73.12 
 
 		 259 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  71.54 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  71.37 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  71.54 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  71.94 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.16 
 
 		 255 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  72.33 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  71.54 
 
 		 266 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  71.54 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  70.75 
 
 		 266 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  71.15 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  71.54 
 
 		 266 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  71.54 
 
 		 266 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  71.15 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  70.36 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  69.57 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  69.17 
 
 		 263 aa  367  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  69.72 
 
 		 285 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  68.77 
 
 		 259 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  68.77 
 
 		 263 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  69.02 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  67.86 
 
 		 261 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  72.62 
 
 		 260 aa  358  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2855  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  71.54 
 
 		 257 aa  357  9e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.717759  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1521  ABC transporter related  71.83 
 
 		 258 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  66.8 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.88 
 
 		 254 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2375  ABC transporter, ATPase subunit  70.59 
 
 		 266 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3794  ABC transporter related  70.59 
 
 		 255 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.921656  normal  0.0592425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  65.88 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  67.98 
 
 		 275 aa  353  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4636  ABC transporter related  70.59 
 
 		 255 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3727  ABC transporter related  70.59 
 
 		 255 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409478  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5001  ABC transporter related  70.2 
 
 		 255 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585593  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5466  ABC transporter related  70.2 
 
 		 255 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3323  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  70.75 
 
 		 257 aa  352  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0414676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3609  ABC transporter related  70.2 
 
 		 255 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  65.86 
 
 		 257 aa  348  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2595  histidine transport ATP-binding protein  70.59 
 
 		 255 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2684  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.57 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3446  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.57 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2456  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.57 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2462  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.57 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.460847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  66.26 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2600  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.57 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1442  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.59 
 
 		 279 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.59 
 
 		 279 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1408  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  69.8 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.106867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  65.85 
 
 		 257 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1346  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 		 257 aa  345  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02231  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 		 257 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.985627  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1350  ABC transporter related protein  69.17 
 
 		 257 aa  345  6e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02191  hypothetical protein  69.17 
 
 		 257 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2592  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 		 258 aa  344  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2701  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 		 258 aa  344  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2580  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 		 258 aa  344  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.676694  normal  0.169811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  65.46 
 
 		 257 aa  344  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2492  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 		 258 aa  344  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.793796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2538  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.17 
 
 		 257 aa  344  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1238  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.2 
 
 		 255 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.251071  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0208  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.2 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0481  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.2 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00989858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1091  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.2 
 
 		 279 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1379  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  69.57 
 
 		 257 aa  341  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.451284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26210  ATP-binding component of histidine transport  68.63 
 
 		 255 aa  340  9e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0271347  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  64.37 
 
 		 256 aa  339  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1431  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  68.38 
 
 		 265 aa  339  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000341956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1541  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  68.38 
 
 		 265 aa  339  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.920327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0350  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  68.38 
 
 		 265 aa  339  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00950632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.63 
 
 		 257 aa  337  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  65.04 
 
 		 257 aa  337  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  63.97 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  63.2 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>