More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1521 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1521  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  526  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  69.5 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  70.66 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  72.66 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  70.93 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  70.93 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  70.93 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  70.93 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.54 
 
 		 264 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  70.93 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  70.54 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  70.04 
 
 		 263 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52750  arginine/ornithine transport protein AotP  74.6 
 
 		 254 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4622  arginine/ornithine transport protein AotP  74.6 
 
 		 254 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4483  basic amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75 
 
 		 254 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  70.43 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  68.34 
 
 		 259 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.16 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  69.88 
 
 		 259 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  70.43 
 
 		 266 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  68.34 
 
 		 259 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  68.73 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1432  ABC transporter related  75 
 
 		 254 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172857  normal  0.392734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3988  ABC transporter related  75 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  70.43 
 
 		 266 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  68.73 
 
 		 259 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  70.16 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  68.34 
 
 		 259 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  68.73 
 
 		 259 aa  367  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  74.21 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 		 255 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  69.65 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2913  ABC transporter related  73.02 
 
 		 254 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.289619 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  69.65 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  69.26 
 
 		 266 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  73.81 
 
 		 254 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  69.84 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  73.41 
 
 		 254 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  70.36 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  69.92 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.36 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4288  ABC transporter-like  73.41 
 
 		 254 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  70.82 
 
 		 275 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2883  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  69.05 
 
 		 257 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  67.7 
 
 		 273 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2375  ABC transporter, ATPase subunit  72.66 
 
 		 266 aa  357  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5001  ABC transporter related  73.12 
 
 		 255 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.585593  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1090  ABC transporter related  71.83 
 
 		 254 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455467  normal  0.0958562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4636  ABC transporter related  73.12 
 
 		 255 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3794  ABC transporter related  73.12 
 
 		 255 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.921656  normal  0.0592425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3727  ABC transporter related  73.12 
 
 		 255 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409478  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1408  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  72.73 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.106867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3609  ABC transporter related  72.73 
 
 		 255 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5466  ABC transporter related  71.94 
 
 		 255 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 		 279 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378834  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1442  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 		 279 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2595  histidine transport ATP-binding protein  71.54 
 
 		 255 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26210  ATP-binding component of histidine transport  71.03 
 
 		 255 aa  344  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0271347  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  68.63 
 
 		 260 aa  342  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0208  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  71.15 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1091  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  71.15 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0481  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  71.15 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00989858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1238  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  71.15 
 
 		 255 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.251071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  62.89 
 
 		 257 aa  341  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.82 
 
 		 254 aa  337  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  62.7 
 
 		 265 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  62.11 
 
 		 257 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  64.82 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  62.75 
 
 		 275 aa  335  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  61.42 
 
 		 257 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  64.82 
 
 		 254 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  62.3 
 
 		 265 aa  335  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  64.17 
 
 		 256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  61.02 
 
 		 257 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  62.26 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2855  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  67.19 
 
 		 257 aa  331  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.717759  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.42 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  62.35 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  63.16 
 
 		 256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  60.63 
 
 		 257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  65.73 
 
 		 265 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  65.73 
 
 		 265 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  62.6 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  65.73 
 
 		 265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2456  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.41 
 
 		 257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2462  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.41 
 
 		 257 aa  325  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.460847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3446  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.41 
 
 		 257 aa  325  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2600  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.41 
 
 		 257 aa  325  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0142427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2684  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.41 
 
 		 257 aa  325  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.186736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3323  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.41 
 
 		 257 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0414676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.87 
 
 		 256 aa  324  7e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  63.16 
 
 		 268 aa  324  9e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2592  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  65.64 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1346  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  66.02 
 
 		 257 aa  323  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.281005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2580  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  65.64 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.676694  normal  0.169811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>