23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5075 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5075  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  57.58 
 
 		 173 aa  210  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  30 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  35.85 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  34.62 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  32.35 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  31.47 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  25.35 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  26.24 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  27.41 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  31.91 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  30.19 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  26.67 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  25.96 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  31.91 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  25.96 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  26.19 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  29 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  25.96 
 
 		 157 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  25.96 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  25.96 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  25.96 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>