50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001568 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  100 
 
 		 125 aa  262  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  68 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  65.32 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  40.65 
 
 		 174 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  38.21 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  39.02 
 
 		 174 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  38.21 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  38.21 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  38.21 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  37.4 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  37.4 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  38.21 
 
 		 175 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  36.59 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  38.68 
 
 		 247 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  32.52 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  41.84 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  34.96 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  35.77 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  36.97 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  32.52 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  34.86 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  33.33 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  32.52 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  36.54 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  34.29 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  38.71 
 
 		 155 aa  66.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  36.67 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  31.15 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  30.95 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  31.62 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  34.71 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  32.38 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  29.17 
 
 		 253 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  34.41 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  31.86 
 
 		 287 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  33.61 
 
 		 288 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  34.92 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 280 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05601  hypothetical protein  22.66 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  27.56 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  31.18 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  26.83 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  30.85 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  31.67 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  28 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  27.56 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>