40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5527 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
135 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  74.8 
 
 
139 aa  208  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  52.1 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  34.71 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  29.03 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  27.48 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  29.03 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  29.03 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5075  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  27.91 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  28.23 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  27.64 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  29.6 
 
 
276 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  28.12 
 
 
254 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  28.12 
 
 
253 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  26.72 
 
 
255 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  31.2 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  28.93 
 
 
158 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  28.93 
 
 
158 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  28.93 
 
 
158 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  29.23 
 
 
157 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  29.23 
 
 
157 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  29.23 
 
 
157 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  30.16 
 
 
162 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  26.4 
 
 
173 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  28.24 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  28.1 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  29.27 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  27.42 
 
 
287 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  27.78 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  24.26 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  32.28 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  26.27 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  28.69 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  26.52 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  29.91 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  24.03 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  22.31 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>