36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5315 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  286  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  74.8 
 
 		 135 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  52.1 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  35.61 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  30.58 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  29.92 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  30.58 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  30.58 
 
 		 174 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  27.35 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  29.75 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5075  hypothetical protein  42.59 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  27.64 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  28.91 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  28.91 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  28.21 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  29.51 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  29.13 
 
 		 173 aa  50.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  25.22 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  26.72 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  26.36 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  27.48 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  26.12 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  26.67 
 
 		 254 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  28.32 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  28.12 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  28 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  27.05 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  25.83 
 
 		 141 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  25.78 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  26.56 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  26.56 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  26.56 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>