46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3274 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  100 
 
 		 287 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  69.69 
 
 		 287 aa  428  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  67.25 
 
 		 288 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  62.59 
 
 		 288 aa  361  9e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  67.19 
 
 		 253 aa  360  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  65.49 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  46.27 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  45.45 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  44.77 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  40.4 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  38.96 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  32.24 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  32.08 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  35.66 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  29.57 
 
 		 164 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  32.31 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  31.88 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  31.16 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  27.59 
 
 		 141 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  32.03 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  31.16 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  30.43 
 
 		 174 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  39.33 
 
 		 160 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  29.75 
 
 		 162 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  31.3 
 
 		 157 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  31.54 
 
 		 127 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  30.89 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  30.89 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  30.89 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  27.5 
 
 		 162 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  30.37 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  28.45 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  28.7 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  27.61 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  31.86 
 
 		 125 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  27.69 
 
 		 158 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  27.69 
 
 		 158 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  27.5 
 
 		 131 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  28.69 
 
 		 158 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  27.14 
 
 		 150 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  35.83 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  27.42 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>