18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2420 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  27.06 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  32.19 
 
 
288 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  26.19 
 
 
288 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  30.43 
 
 
287 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  25.77 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  26.44 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  26.92 
 
 
287 aa  58.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  27.12 
 
 
276 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  23.53 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  26.83 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  28.81 
 
 
255 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  24.1 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 
157 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  27.97 
 
 
162 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  27.97 
 
 
162 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  42.86 
 
 
155 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  27.97 
 
 
157 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>