43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2852 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  527  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  54 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  49.21 
 
 
253 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  46.48 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  46.27 
 
 
287 aa  249  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  44.92 
 
 
287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  43.19 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  45.75 
 
 
288 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  37.72 
 
 
276 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  36.36 
 
 
280 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  33.2 
 
 
254 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  28.19 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  30.84 
 
 
155 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  28.36 
 
 
130 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  29.38 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  30.13 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  28.12 
 
 
174 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  30.48 
 
 
127 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  28.12 
 
 
174 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  32.38 
 
 
125 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 
157 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  32.26 
 
 
125 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  24.62 
 
 
150 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  25.42 
 
 
162 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  25.42 
 
 
162 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  28.23 
 
 
141 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  31.67 
 
 
164 aa  48.9  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  25.22 
 
 
157 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  26.67 
 
 
157 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  35.56 
 
 
129 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  25.22 
 
 
157 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  34.94 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  24.35 
 
 
157 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  34.94 
 
 
158 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  28.46 
 
 
151 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  24.1 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  34.83 
 
 
155 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  33.73 
 
 
158 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  32.53 
 
 
158 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  25.41 
 
 
170 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  32.1 
 
 
160 aa  42  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  24.58 
 
 
156 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>