56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0708 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  40.5 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  40.5 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  36.67 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  39.67 
 
 		 174 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  39.67 
 
 		 175 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  43.55 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  43.55 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  43.55 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  42.74 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  43.55 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  42.74 
 
 		 162 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  45.52 
 
 		 158 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  38.66 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  45.52 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  46.27 
 
 		 158 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  46.27 
 
 		 158 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  43.8 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  39.52 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  40.48 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  37.3 
 
 		 160 aa  89.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  39.34 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  39.42 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  36.54 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  37.4 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  34.59 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  32.12 
 
 		 254 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  33.98 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  40.2 
 
 		 276 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  34.15 
 
 		 288 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  33.87 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  27.73 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  28.46 
 
 		 255 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  27.45 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  27.19 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  28.7 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  25.83 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  27.68 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  29.66 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  28.32 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  26.98 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  27.07 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  34.02 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  27.42 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  27.59 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  25.83 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  27.59 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2366  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 768 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00256663  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 767 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 725 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 767 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 760 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 760 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 760 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 760 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 		 119 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000849743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>