43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2880 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  44.53 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  44 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  44 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  44 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  43.2 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  43.2 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  42.4 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  39.06 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  34.68 
 
 		 174 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  42.45 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  34.68 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  34.68 
 
 		 174 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  34.4 
 
 		 175 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  40.16 
 
 		 160 aa  90.1  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  40.8 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  40.8 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  39.02 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  32.52 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  36.76 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  28.46 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  29.51 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  34.35 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  33.98 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  32.52 
 
 		 255 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  29.69 
 
 		 254 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  29.9 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  38.05 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  31.36 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  30 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  36.67 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  35.87 
 
 		 288 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  29.2 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  36.26 
 
 		 253 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  31.11 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  35.56 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  27.18 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  35.83 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  25.74 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  41.07 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  22.31 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>