19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3618 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  30.56 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  34.92 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  45.45 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  38.6 
 
 		 276 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  31.43 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  43.1 
 
 		 174 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  43.86 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  43.86 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  43.1 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  43.1 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  43.86 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  41.07 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  43.86 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  39.13 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  43.86 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  44.64 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  44.64 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  44.64 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>