51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10133 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  266  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  68 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  65.85 
 
 		 127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  44.72 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  43.9 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  43.09 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  43.09 
 
 		 174 aa  100  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  39.84 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  39.84 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  39.02 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  39.84 
 
 		 158 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  39.02 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  37.4 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  37.4 
 
 		 157 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  37.4 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  37.4 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  37.4 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  34.96 
 
 		 157 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  37.4 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  36.59 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  39.42 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  35.14 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  38.21 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  38.32 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  32.11 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  28.46 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  31.4 
 
 		 255 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  28.1 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  27.64 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  28.46 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  32.77 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  27.64 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 287 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  29.31 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  28.33 
 
 		 253 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  32.26 
 
 		 254 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  33.9 
 
 		 276 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  29.84 
 
 		 254 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  30.97 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  33.7 
 
 		 162 aa  48.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  30.56 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 280 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  27.5 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  28.72 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  31.78 
 
 		 288 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  25.86 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  23.88 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  22.9 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 287 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>