57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4899 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  97.53 
 
 		 162 aa  296  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  93.57 
 
 		 157 aa  259  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  97.6 
 
 		 157 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  97.6 
 
 		 157 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  96.8 
 
 		 157 aa  256  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  80.8 
 
 		 157 aa  219  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  64.52 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  52.76 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  44.68 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  52.76 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  52.76 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  52.76 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  43.97 
 
 		 174 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  43.97 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  45.93 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  43.65 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  43.2 
 
 		 129 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  45.21 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  43.55 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  40.98 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  38.21 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  36.49 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  37.4 
 
 		 125 aa  88.2  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  40.17 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  30.33 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  31.76 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  35.71 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  32.35 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  31.86 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  30.23 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  31.78 
 
 		 276 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  32.28 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  33.81 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  31.67 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  28.67 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  27.21 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  29.11 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  27.59 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  29.46 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2299  hypothetical protein  32.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  36.9 
 
 		 280 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  28.95 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  30.16 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  28.12 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  30.88 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  25.17 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  27.97 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  32.84 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  32.84 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  27.73 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>