51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3628 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  320  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  320  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  97.47 
 
 
158 aa  263  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  93.67 
 
 
158 aa  253  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  64.47 
 
 
155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  46.76 
 
 
174 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  48.57 
 
 
175 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  46.76 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  46.04 
 
 
174 aa  141  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  49.63 
 
 
157 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  52.76 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  53.6 
 
 
157 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  53.6 
 
 
157 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  53.6 
 
 
157 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  52.8 
 
 
157 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  50.4 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  51.18 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  48.78 
 
 
151 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  45.38 
 
 
127 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  45.59 
 
 
141 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  37.16 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  39.84 
 
 
125 aa  94.4  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  40.8 
 
 
129 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  38.4 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  43.64 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  41.13 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  32.47 
 
 
254 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  32.79 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  34.78 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  34.51 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  32.61 
 
 
247 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  32.14 
 
 
253 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  30.5 
 
 
255 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  31.25 
 
 
122 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  28.91 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  29.08 
 
 
253 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  33.93 
 
 
276 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  28.68 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  28.24 
 
 
287 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  28.93 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  28.99 
 
 
287 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  26.24 
 
 
288 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  34.78 
 
 
254 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  29.82 
 
 
131 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  25.9 
 
 
288 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  36.14 
 
 
280 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  30.09 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  25.44 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.8 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  44.64 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  29.75 
 
 
142 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>