56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5449 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  97.53 
 
 
162 aa  296  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  93.02 
 
 
157 aa  253  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  96 
 
 
157 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  96 
 
 
157 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  95.2 
 
 
157 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  79.2 
 
 
157 aa  214  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  62.9 
 
 
151 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  45.39 
 
 
174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  44.68 
 
 
174 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  44.68 
 
 
174 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  51.18 
 
 
158 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  51.18 
 
 
158 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  51.18 
 
 
158 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  51.18 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  44.37 
 
 
175 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  42.86 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  44.52 
 
 
155 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  42.4 
 
 
129 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  42.74 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  40.98 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  38.21 
 
 
125 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  37.4 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  40.52 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  32.79 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  34.07 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  31.86 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  31.08 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  35.11 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  30.23 
 
 
254 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  32.06 
 
 
276 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  31.37 
 
 
247 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  36.36 
 
 
288 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  31.58 
 
 
287 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  31.39 
 
 
255 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  31.67 
 
 
142 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  36.89 
 
 
288 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  30.38 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  25.34 
 
 
287 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  27.59 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  31.2 
 
 
135 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2299  hypothetical protein  32.93 
 
 
116 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  28.07 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  36.9 
 
 
280 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  27.86 
 
 
185 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  26.67 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  27.97 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  25.66 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  45.45 
 
 
93 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  30.88 
 
 
122 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  27.73 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  26.55 
 
 
140 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>