47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2434 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  49.01 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  45.45 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  43.15 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  40.89 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  44.31 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  44.09 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  37 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  37.72 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  37.28 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  30.29 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  36.43 
 
 		 175 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  34.43 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  35.34 
 
 		 174 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  34.81 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  34.81 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  34.4 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  40.2 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  32.06 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  33.98 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  32.79 
 
 		 157 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  32.79 
 
 		 157 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  32.79 
 
 		 157 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  32.31 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  32.79 
 
 		 162 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  32.24 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  40.74 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  27.12 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  30.25 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  34.35 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  34.71 
 
 		 125 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  31.01 
 
 		 160 aa  52.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  33.61 
 
 		 127 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  29.6 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  26.8 
 
 		 133 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  32.17 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  26.12 
 
 		 139 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  31.82 
 
 		 164 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  38.6 
 
 		 93 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>