57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5599 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  315  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  65.12 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  65.32 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  65.32 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  65.32 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  64.52 
 
 		 162 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  64.52 
 
 		 157 aa  173  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  62.9 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  48.78 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  47.97 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  48.78 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  48.78 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  46.77 
 
 		 174 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  45.97 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  45.97 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  45.16 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  42.28 
 
 		 155 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  40.16 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  39.06 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  40.48 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  38.84 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  36.75 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  39.55 
 
 		 288 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  31.97 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  32.52 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  34.27 
 
 		 247 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  34.06 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  36.72 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  28 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  33.08 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  34.4 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  37.4 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  31.4 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  35.66 
 
 		 287 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  34.74 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  31.25 
 
 		 255 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  34.19 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  30.83 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  27.35 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000849743  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  26.95 
 
 		 254 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2299  hypothetical protein  32 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  28.69 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  27.87 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  31.25 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  26.05 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3618  hypothetical protein  39.13 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00973052 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  27.05 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5075  hypothetical protein  30.85 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  27.14 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  31.09 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  27.12 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>