46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2361 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  510  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  38.2 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  38.96 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  39.5 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  37.08 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  38.63 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  36.48 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  36.25 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  37.28 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  30.12 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  27.73 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  38.68 
 
 		 125 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  36.79 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  35.14 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  33.01 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  32.59 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  32.04 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  35.71 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  34.78 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  32.04 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  37.19 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  32.35 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  32.35 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  33.7 
 
 		 158 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  32.35 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  32.61 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  34 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  31.37 
 
 		 162 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  25.77 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  32.61 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  27.45 
 
 		 141 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  27.87 
 
 		 150 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  27.41 
 
 		 130 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  38.78 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  25.74 
 
 		 129 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  25.98 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  29.7 
 
 		 164 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  26.89 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  27.27 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>