44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4898 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  75.6 
 
 		 255 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  67.19 
 
 		 287 aa  360  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  64.03 
 
 		 287 aa  342  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  64.71 
 
 		 288 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  60.39 
 
 		 288 aa  323  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  49.21 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  45.45 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  44.09 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  40.61 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  41.15 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  38.2 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  32.46 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  38.18 
 
 		 155 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  27.06 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  34.53 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  36.72 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  35.4 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  34.29 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  34.38 
 
 		 162 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  28.48 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  28.48 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  33.59 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  36.7 
 
 		 127 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  34.09 
 
 		 158 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  29.03 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  30.71 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  27.82 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  31.15 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  32.81 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  28.7 
 
 		 141 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  36.67 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  33.33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  30 
 
 		 155 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  30.36 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  36.26 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  30.25 
 
 		 170 aa  49.3  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  28.12 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>