50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4731 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
155 aa  313  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  70 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  68.46 
 
 
158 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  68.46 
 
 
158 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  68.46 
 
 
158 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  56.49 
 
 
174 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  54.96 
 
 
174 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  54.96 
 
 
174 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  50.7 
 
 
175 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  51.61 
 
 
160 aa  121  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  51.61 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  51.61 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  50.81 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  50.81 
 
 
157 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  45.08 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  42.96 
 
 
157 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  43.8 
 
 
141 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  35.17 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  41.8 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  39.84 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  44.72 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  38.21 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  40 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  34.15 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  36.64 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  35.48 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  34.82 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
255 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  30.69 
 
 
247 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  33.08 
 
 
255 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5315  hypothetical protein  29.75 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  31.01 
 
 
253 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  30.37 
 
 
287 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  28.86 
 
 
287 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  29.17 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  32.97 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  31.03 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  36.08 
 
 
288 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  30.47 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  32.65 
 
 
254 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  29.03 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  25.58 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  23.23 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  27.73 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>