41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4656 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  100 
 
 		 287 aa  590  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  69.69 
 
 		 287 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  70.38 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  68.8 
 
 		 255 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  60.76 
 
 		 288 aa  348  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  64.03 
 
 		 253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  46.64 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  44.92 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  46.7 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  42.79 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  36.03 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  39.5 
 
 		 247 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  36.28 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  32.58 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  33.08 
 
 		 130 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  32.28 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  32.52 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  26.92 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  31.93 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  36.14 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  30.09 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  31.36 
 
 		 129 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  28.86 
 
 		 155 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  30.6 
 
 		 151 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  39.29 
 
 		 160 aa  52.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  31.37 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  38.2 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  38.2 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  38.2 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  28.78 
 
 		 157 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  37.08 
 
 		 162 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  30.15 
 
 		 158 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  28.33 
 
 		 162 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  34.02 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  28.79 
 
 		 158 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  28.99 
 
 		 158 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  28.99 
 
 		 158 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  27.91 
 
 		 150 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  26.89 
 
 		 170 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  30.28 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  31.67 
 
 		 125 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>